Мета: В ході курсу лекцій дисципліни «Комп´ютерне моделювання стану популяцій» занять аспіранти ознайомляться з математичними поняттями і популярними методами комп'ютерного моделювання, знання яких необхідне для успішного дослідження в області біотехнології; освоять відомий пакет програм, до складу якого входять CMSY, AMSY, BSM, LBB, BCrumb для комп'ютерного моделювання стану популяцій.

Завдання:

• Освоїти основні математичні поняття і методи, які використовуються при комп'ютерному моделюванні стану популяцій;
• Набути навичок обробки, класифікації, аналізу інтерпретації даних у відповідному програмному забезпеченні.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

• ОЦІНКА ЗАПАСУ ПРОМИСЛОВИХ ВИДІВ КОРОПОВИХ РИБ ПРИДУНАЙСЬКИХ ОЗЕР
• ОЦІНКА РИБОПРОДУКТИВНОСТІ ПРИДУНАЙСЬКИХ ОЗЕР ЗА СТАНОМ МАКРОЗООБЕНТОСУ
• ПОСИЛАННЯ НА МЕТОДИЧНІ ТА ДОВІДКОВІ МАТЕРІАЛИ
  
  СИЛАБУС

Метою дисципліни «Молекулярні маркери» є розширення у здобувачів третього освітнього рівня уявлень про структурну організацію та використання молекулярних маркерів для визначення генетичного поліморфізму в генотипах еукаріот, для вивчення еволюційних процесів, що відбуваються при формуванні складних геномів еукаріот.

Завдання дисципліни:

• ознайомити здобувачів з сучасними інструментами і технологіями визначення генетичного поліморфізму;
• сформувати у здобувачів уявлення про способи маркування генетичного матеріалу, системи маркерів, їх інформативність, переваги та недоліки;
• сформувати у здобувачів уявлення про принципи застосування різних типів молекулярних маркерів для визначення генетичного поліморфізму;
• довести до уваги здобувачів важливість і необхідність використання молекулярних маркерів для вирішення фундаментальних та практичних питань біології, селекції, медицини;
• сформувати у здобувачів уявлення про маркер опосередковану селекцію (markerassistedselection (MAS));
• ознайомити здобувачів з методами аналізу асоціацій між молекулярними маркерами та фенотиповими  ознаками.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:
Молекулярно-генетичні маркери адаптації до гіпоксії у спортсменів

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Метою дисципліни «Геноміка (теоретичні та практичні аспекти)» є розширення у здобувачів уявлень про організацію й функціонування  геномів прокаріот та еукаріот, еволюційні процеси, що відбуваються при формуванні складних геномів еукаріот, поліплоїдизації, прогрес, що відбувся у геноміці із використанням NewGenerationSequencing технологій, знайомство з методами анотування геномних послідовностей та аналізу міжнародних баз даних геномних послідовностей. Особлива увага приділяється способам вилучення функціональної інформації з наявних геномних послідовностей.

Завдання:

• ознайомити здобувачів з організацією геномів прокаріот та еукаріот, з порівняльними дослідженнями анотованих геномів та секвенованих генних послідовностей;
• ознайомити здобувачів з сучасними інструментами і технологіями структурного і функціонального аналізу геномів;
• розширити у здобувачів уявлення про молекулярні бази даних NCBI, ЕМВL та ін., спеціалізацію, структуру і методи пошуку в них інформації;
• вдосконалити знання та вміння здобувачів, щодо використання основних комп'ютерних програм для порівняння геномних послідовностей (пакети ВLАSТ, MAFFT, MUSCLE);
• довести до уваги здобувачів важливість і необхідність геномних розробок для розвитку і вирішення фундаментальних та практичних питань біології, сільського господарства, медицини;
• сформувати у здобувачів уявлення про геномну селекцію, ознайомити з методами аналізу асоціацій між геномними локусами та фенотиповими ознаками;
• сформувати у здобувачів уявлення про епігенетичні механізми регуляції реалізації генетичної інформації.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

      РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

CУЧАСНИЙ СТАН СЕКВЕНУВАННЯ ЯДЕРНОГО ГЕНОМУ ПШЕНИЦІ (TRITICUM AESTIVUM L.)

СИЛАБУС

Метою дисципліни «Сучасні ДНК-технології» є розширення у здобувачів третього освітнього рівня уявлень про сучасні ДНК технології їх використання в молекулярно генетичних дослідженнях прокаріот та еукаріот, в прикладних розробках сучасної молекулярної біології.

Завдання дисципліни:

• ознайомити здобувачів з сучасними ДНК-технологіями визначення генетичного поліморфізму;
• сформувати у здобувачів уявлення про DArT технологію скринінгу генетичного матеріалу;
• сформувати у здобувачів уявлення про принципи застосування microarray технології.
• сформувати у здобувачів уявлення про маркер опосередковану селекцію (marker assisted selection (MAS)), уявлення про транскриптомні дослідження, їх значення для медицини і сільського господарства.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

      РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

CУЧАСНИЙ СТАН СЕКВЕНУВАННЯ ЯДЕРНОГО ГЕНОМУ ПШЕНИЦІ (TRITICUM AESTIVUM L.)

БІОІНФОРМАТИВНИЙ АНАЛІЗ НУКЛЕОТИДНИХ ПОСЛІДОВНОСТЕЙ АЛЕЛІВ ГЕНІВ КОРОТКОСТЕБЛОВОСТІ ПШЕНИЦІ RHT-B1 ТА RHT-D1

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Метою дисципліни «ДНК-типування біологічних об’єктів» є розширення у здобувачів третього освітнього рівня уявлень про методи, як використовуються для генотипування біологічних об’єктів, їх ідентифікації, визначення генетичної спорідненості й автентичності. Такі методи застосовуються в прикладних розробках для паспортизації генотипів сільськогосподарських рослин, захисту авторських прав, в сучасній медицині і судово-медичній експертизі.

Завдання дисципліни:

• ознайомити здобувачів з сучасними технологіями генотипування, зокрема генотипуванням шляхом секвенування та з використанням мікрочипів, SNP- і iPBS-генотипуванням;
• сформувати у здобувачів уявлення про DАrT технологію скринінгу генетичного матеріалу;
• сформувати у здобувачів уявлення про технологіюДНК-фінгерпринтингу, у тому числі із використанням iPBS маркерів;
• сформувати у здобувачів уявлення про застосування ДНК-технологій генотипування для захисту авторських прав на сорти рослин
• ознайомити здобувачів з генотипуванням людини у медичних цілях з метою визначення схильності до різного роду захворювань та для проведення судово-медичних експертиз.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

      РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:
ВИКОРИСТАННЯ ПЛР-АНАЛИЗУ В ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦІЙНИХ ДОСЛІДЖЕННЯХ

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Мета курсу «Екологічна оцінка впливу на довкілля» є набуття у аспірантів здатності до аналізу і планування екологічної оцінки впливу на довкілля, моніторингу та обґрунтування діяльності в природоохоронної та проектної документації, навчити використовувати методі і принципи оцінки впливу на навколишнє природне середовище та проведення державної екологічної експертизи.

Завдання:

• знайомство з теоретичними, методичними та практичними заходами екологічного об-ґрунтуванні господарської та іншої діяльності нарівні проектуванні та техніко-економічного обґрунтуванні;
• проектування, будови та експлуатації об'єктів;
• знайомство с нормативно-правової базою геоекологічного проектування;
• забезпечити наявність необхідного рівня знань, вмінь та навичок з проблем екологічної експертизи в України та світу.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:
Методичні рекомендації до самостійної роботи
ПЛАН ПРАКТИЧНИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Мета дисципліни «Біологічні колекції у науковій і освітній діяльності»– скласти у здобувачів уявлення про генетичні колекції, ботанічні колекції, зоологічні колекції, сучасні методи зберігання та вивчення колекцій, навчити аспірантів практично застосовувати можливості музейних просторів, колекцій та баз даних для виконання власного наукового дослідження. 

Завдання:

• Познайомитися з історією виникнення та використання біологічних колекцій
• Набуття знань щодо принципів і приводів для створення колекцій
• Формування вмінь створювати колекції за різними принципами
• Знайомство з потенціалом регіону щодо репрезентативних колекцій різних типів
• Формування вмінь та навичок збереження та підтримання колекцій
• Розвиток підприємливості щодо поповнення, обміну, придбання та продажу об’єктів, що можуть входити до колекцій
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

Гербарна колекція Г.Й. Потапенка

Гербарна колекція Е.Е. Ліндеманна

Гербарна колекція Й.К. Пачоського

Гербарна колекція П.С. Шестерікова

Атлас Drosophila melanogaster

ПЛАН ПРАКТИЧНИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Мета дисципліни "Нові підходи до вивчення метаболізму біоактивних речовин" полягає у формуванні спеціальних фахових компетентностей, спрямованих на засвоєння сучасних уявлен про будову,функції та метаболізм біологічно-активних речовин у організмі людини та тварин як регуляторів метаболічних процесів у нормі та при патології.

Завдання:

• Надати загальне уявлення про метаболоміку,можливості використання її складових в біотехнологічних та біологічних дослідженнях.
• Розкрити особливості просторової структури,локалізації та регуляції метаболомів в клітинах.
• Пояснити основні методи афінної взаємодії ферментів з субстратами та ефекторами.
• Ознайомити з загальними методичними прийомами виділення та визначення біоактивних речовин.
• Ознайомити з сучасними підходами до визначення метаболомів та інтерпретації даних метаболомного аналізу.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ (Переглянути/Завантажити)

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА

МЕДИЧНА ЕНЗИМОЛОГІЯ

ПАТОЛОГІЧНА БІОХІМІЯ

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Метою дисципліни «Молекулярні механізми інформаційної комунікації» є ознайомлення здобувачів з основними принципами міжклітинної комунікації у мікроорганізмів, з процессом формування біоплівки на основі сучасних наукових даних, а також набуття ними вмінь планувати та проводити дослідження систем міжклітинної комунікації у бактерій та пов’язаних з нею властивостей.

          Завдання:

• Ознайомити з молекулярно-біологічними процесами міжклітинної комунікації у мікроорганізмів;
• Надати здобувачам знання про основні механізми взаємодії сигнальних та ферментативних систем у клітині;
• Ознайомити з основними відмінностями систем quorumsensingу різних груп мікроорганізмів;
• Надати знання про молекулярно-біологічні засади взаємодії прокаріотичних та еукаріотичних клітин;
• Надати знання про біоплівки як основну форму існування мікробних співтовариств у природі, утворення яких залежить від сигнальних систем міжклітинної комунікації;
• Ознайомити з особливостями структурно-функціональної організації біоплівок та закономірностями процессу їх утворення;
• Надання знання про значення сигнальних систем мікроорганізмів у природі та житті людини.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ (Переглянути/Завантажити)

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:
Молекулярні механізми інформаційної комунікації мікроорганізмів
Загальна характеристика біоплівки. Основні принципи будови.

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС 

Метою курсу «Поглиблені методи статистики в біологічних і біомедичних дослідженнях» є практичне застосування методів математичної статистики для обробки біологічних та біомедичних даних та прищепленню культури застосування статистичних методів.

До завдань курсу належить:

• Навчити слухача формувати вибірки з великої кількості даних;
• Вірно відібрати методи аналізу, та аналізувати потужності критеріїв;
• Поглиблене вивчення можливості візуалізація і аналізу даних на мові R;
• Навчити слухача визначати взаємозв'язок між категоріальними змінними на основі статистичних тестів;
• Застосовувати непараметричні критерії;
• Будувати однофакторні та багатофакторні дисперсійні моделі;
• Будувати парні та множинні лінійні моделі регресії;
• Будувати нелінійні моделі регресії;
• Будувати модель логістичної регресії та пробіт-модель.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

МАТЕМАТИЧНІ МЕТОДИ З ВИКОРИСТАННЯМ R

ПЛАН ПРАКТИЧНИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Метою дисципліни «Адаптивні реакції мікроорганізмів до стрес факторів» є надання знань з питань адаптивних реакцій мікроорганізмів щодо стрес-факторів навколишнього середовища та молекулярних механізмів цих адаптацій.

Завдання:

• надати здобувачам знання про основні стрес-фактори навколишнього середовища, які впливають на життєздатність мікроорганізмів;
• ознайомити з механізмами впливу природних факторів (температура, солоність, високий тиск тощо), токсикантів та ксенобіотиків;
• надати здобувачам знання щодо адаптивних реакцій мікроорганізмів;
• розкрити  молекулярно-біологічні основи адаптивних реакцій  мікроорганізмів.
  
  ПРЕЗЕНТАЦІЯ КУРСУ

     РОБОЧА ПРОГРАМА КУРСУ

МЕТОДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ КУРСУ:

Лекційний матеріал

ПЛАН СЕМІНАРСЬКИХ ЗАНЯТЬ

СИЛАБУС

Силабус

Робоча програма